Student World

***tisková zpráva společnosti IBM

Tým výzkumníků renomovaného ústavu Scripps Research Institute objevil dvě nové sloučeniny, které potvrzují existenci nových vazebných míst na HIV proteáze. Profesor C. David Stout, hlavní autor studie, uvedl: „Tyto výsledky otevírají dveře zcela novému přístupu při vývoji léků proti HIV proteáze,“ enzymu, s jehož pomocí vytváří virus HIV nové, infekční virové částice.

Podle Světové  zdravotnické organizace v současnosti žije s infekcí HIV asi 33 milionů lidí.

Na zmíněném výzkumu se podíleli dva členové týmu FightAIDS@Home, výzkumný pracovník Alex L. Perryman, Ph.D. a profesor Arthur J. Olson, kteří nyní pracují na dalším rozšíření výzkumu. Tento objev bude základem vývoje nových léků v boji s rostoucím počtem rezistentních kmenů HIV a zlepšení účinnosti současné léčby. Výsledky se tak stávají východiskem pro vývoj nové generace účinnějších léků na HIV/AIDS.

Díky 1,5 milionu počítačů připojených k síti World Community Grid jsou nová vazebná místa na HIV proteáze podrobována virtuálním screeningovým experimentům, které jsou vodítkem při vývoji nové třídy inhibitorů HIV.

World Community Grid sdružuje nevyužitý výpočetní výkon 1,5 milionu osobních počítačů dobrovolníků z více než 80 zemí světa. Je v současnosti největší veřejnou humanitární sítí na světě, jejíž výkon je ekvivalentní 15. nejvýkonnějšímu superpočítači světa. Za pouhých pět let poskytl projektu výzkumného ústavu Scripps více než 107 000 let výpočetního času a zpracoval na 104 miliony výpočtů.

Jakmile vstoupí virus HIV do lidské buňky, přinutí ji pomocí bílkovin zvaných enzymy vytvářet jeho vlastní kopie. Kopie viru potom infikují další buňky. Většina léků proti HIV funguje tak, že blokují jeden nebo více těchto enzymů. Současný výzkum vědců ústavu Scripps je zaměřen na vývoj nových sloučenin, jež by stabilizovaly tzv. inhibovanou konformaci (neboli tvar) enzymu HIV proteáza, a tím pomohly zastavit replikaci viru. Protože HIV podléhá velmi častým mutacím, některé léky zaměřené na blokaci replikace enzymu již nefungují nebo nefungují dostatečně účinně. Tým Scripps se snaží pomocí výpočtů realizovaných v rámci projektu World Community Grid FightAIDS@Home vyvinout nové léky, jenž by se vázaly na více míst mutovaného enzymu, a tím by jej blokovaly efektivněji.

World Community Grid poskytuje vědcům výkon superpočítačů v hodnotě milionů dolarů, který by pro ně byl jinak nedostupný, zcela zdarma a urychluje tak humanitární výzkumy.

Ve druhé  studii nedávno publikované v časopisu Journal of Molecular Biology použil tým Scripps počítačové modelování k lepšímu pochopení mechanismu působení dalšího HIV enzymu (významného terapeutického cíle) – integrázy. Integráza, vedle proteázy a třetího enzymu – reverzní transkriptázy, je jedním z klíčových proteinů, které umožňují viru HIV převzít buněčné děje hostitelské buňky a replikovat sebe sama. Vytvoření přesnějšího modelu integrázy umožňuje hledat nové molekuly léčiv, které budou inhibovat i mutantní formy tohoto enzymu rezistentní vůči stávajícím lékům. Na výzkum nového léku proti HIV integráze byl týmu Scripps nedávno udělen vládní grant v rámci zákona American Recovery and Reinvestment Act.

Chcete-li věnovat nevyužitý výpočetní čas svého počítače na humanitární  výzkum v různých oblastech včetně léčby rakoviny, vývoje výživnější rýže, nebo zajištění efektivnějších zdrojů energie, navštivte web www.worldcommunitygrid.org.

autor